| 立项时间 | 序号 | 专业名称 | 负责人 | 所在学院、系 |
| 2007年 | 1 | 过程装备与控制工程 | 郑津洋 | 化学工程与生物工程学系 |
| 2 | 生物医学工程 | 夏顺仁 | 生物医学工程与仪器科学学院 | |
| 3 | 工业设计 | 孙守迁 | 计算机科学与技术学院 | |
| 4 | 建筑学 | 王 竹 | 建筑工程学院 | |
| 5 | 能源与环境系统工程 | 岑可法 | 能源工程学系 | |
| 6 | 高分子材料与工程（经费自筹） | 郑 强 | 高分子科学与工程学系 | |
| 7 | 环境科学（经费自筹） | 朱利中 | 环境与资源学院 | |
| | ||||
| 2008年 | 1 | 汉语言文学 | 吴秀明 | 人文学院 |
| 2 | 数学与应用数学 | 李胜宏 | 数学系 | |
| 3 | 生物科学 | 常 杰 | 生命科学学院 | |
| 4 | 机械电子工程 | 王庆丰 | 机械工程学系 | |
| 5 | 自动化 | 韦巍 宋执环 | 电气工程学院控制科学与工程学系 | |
| 6 | 化学工程与工艺 | 李伯耿 | 化学工程与生物工程学系 | |
| 7 | 教育学（经费自筹） | 徐小洲 | 教育学院 | |
| | ||||
| 2009年 | 1 | 机械工程及自动化 | 陈子辰 | 机械系 |
| 2 | 电气工程及其自动化 | 潘再平 | 电气学院 | |
| 3 | 信息工程 | 刘 旭 | 光电系 | |
| 4 | 环境工程 | 陈英旭 | 环资学院 | |
| 5 | 物理学 | 盛正卯 | 物理学系 | |